v6.0 — Module 6 : Techniques d'électrophorèse

Module 6 — Techniques d'électrophorèse (20 h)

Licence 3 — Techniques de laboratoire en Biochimie-Génétique · Semestre 5 · UEF 3.1
Volume horaire : 20 h (8 h CM · 6 h TD · 6 h TP) — 2 crédits ECTS

Cette release marque l'intégration du module 6 sur main (PR #6). Le dépôt couvre désormais
quatre modules d'analyse instrumentale : spectrophotométrie moléculaire (M3), spectrophotométrie
atomique (M4), chromatographie (M5) et électrophorèse (M6).

Comme les modules précédents, le module 6 est produit par une chaîne entièrement scriptée à partir
d'un référentiel de contenu unique (scripts/contenu_module6_electro.py) qui alimente
simultanément les polycopiés Word, le diaporama, la version web interactive et l'audit.

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PDF du dispositif d'évaluation

Les quatre PDF prêts à imprimer, téléchargeables directement depuis le dépôt à la révision de cette
release :

Fichier	Épreuve	Pages	Taille
M6_CC1_Sujet.pdf	Contrôle continu n° 1 — énoncé	5	13,6 ko
M6_CC1_Corrige.pdf	Contrôle continu n° 1 — corrigé-barème	10	30,1 ko
M6_ExamenFinal_Sujet.pdf	Examen final — énoncé	6	16,0 ko
M6_ExamenFinal_Corrige.pdf	Examen final — corrigé-barème	12	39,4 ko

Note — comme pour la release v1.2, la pièce jointe des binaires n'a pas pu être effectuée
depuis l'environnement d'exécution : l'accès à uploads.github.com y est filtré au niveau TLS
(la connexion TCP aboutit, mais la poignée de main est interrompue), alors que api.github.com
reste joignable. Les fichiers sont intégralement disponibles via les liens ci-dessus et pourront
être rattachés à la release dès que cet accès sera rétabli.

Dispositif d'évaluation

Épreuve	Programme	Durée	Barème
Contrôle continu n° 1	Chapitres 1 à 4	1 h 30	Synthèse 8 · Calcul 8 · QCM 4 — 20 pts
Examen final	Chapitres 1 à 8	1 h 30	Synthèse 10 · Calcul 6 · QCM 4 — 20 pts

Chaque épreuve propose deux sujets au choix en partie A (synthèse) et deux sujets au choix
en partie B (calcul) ; le QCM de 16 items à réponse unique est commun
(+ 0,25 / − 0,0625 / 0, plancher 0).

Note finale du module = 0,20 × CC1 + 0,30 × comptes rendus de TP + 0,50 × Examen final

Les corrigés sont des corrigés-barèmes utilisables directement par le correcteur : réponse
attendue découpée en éléments notés séparément, répartition des points au quart de point près,
erreurs fréquentes à sanctionner avec leur pénalité, et synthèse finale des erreurs les plus
courantes destinée à la séance de correction.

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Contenu du module

Cours magistral — 8 chapitres

1. Définitions, principes physiques, forces et appareillage — bilan F = qE contre F = 6πηrv,
   vitesse v = qE/(6πηr), mobilité μ = q/(6πηr), Rf, effet du pH et pI, cuves horizontale et
   verticale, effet Joule P = U·I = R·I², sécurité électrique, électro-osmose
2. Gel d'agarose — gélification thermoréversible, tamisage (Ogston, reptation, reptation orientée),
   relation de Ferguson, choix de 0,5 % à 3 %, TAE contre TBE, révélation, diagnostic des anomalies
3. Acides nucléiques et protéines végétales — droite log M = f(Rf), conformères plasmidiques, ARN
   en conditions dénaturantes, extraction TCA-acétone, matrices végétales difficiles, densitométrie
4. SDS-PAGE, système discontinu de Laemmli — %T et %C, triple effet du SDS (1,4 g·g⁻¹), gels 4–5 %
   à pH 6,8 et 8–15 % à pH 8,8, empilement par isotachophorèse transitoire, écarts de masse
5. IEF, isotachophorèse, immunoélectrophorèse — ampholytes et gradients immobilisés, volts-heures,
   fonction de Kohlrausch, Ouchterlony, Laurell, immunofixation
6. Western blot — transfert en cuve / semi-sec / rapide, nitrocellulose contre PVDF, Ponceau,
   saturation, immunodétection indirecte, ECL, quantification et contrôles de charge
7. 2D-PAGE, électrophorèse capillaire et PFGE — capacité de pics n₁ × n₂, modes CZE/CGE/MEKC/cIEF,
   efficacité N = μ·V/(2D), temps de réorientation t_r ∝ L^1,5–2, OFAGE / FIGE / CHEF
8. Stratégie analytique — arbre décisionnel analyte → technique, validation de méthode, perspectives

Travaux pratiques — TP 1 agarose (ADN plasmidique, produits de PCR, ARN totaux) · TP 2
extraction des protéines de feuilles et de graines, Bradford et SDS-PAGE Laemmli · TP 3 Western
blot de la grande sous-unité de la Rubisco, transfert semi-sec, ECL et densitométrie.

Livrables commités dans le dépôt

Livrable	Chemin	Détail
Polycopié Cours	modules/module06_electrophorese/output/M6_Cours_Electrophorese.docx	8 chapitres, 12 figures, 84 tableaux et encadrés, ≈ 21 000 mots, glossaire (25 entrées), bibliographie APA (29 réf.)
Polycopié TD	.../output/M6_TD_Electrophorese.docx	10 questions de synthèse, 10 exercices de calcul, 20 QCM, énoncés puis corrigés détaillés (≈ 17 800 mots)
Polycopié TP	.../output/M6_TP_Electrophorese.docx	3 séances de 3 h pour 5 binômes : matériel, réactifs chiffrés, sécurité, mode opératoire, grille de notation (≈ 10 000 mots)
Diaporama	.../output/M6_Diaporama_Electrophorese.pptx	98 diapositives 16:9, ≤ 10 lignes par cadre, 0 chevauchement sur 307 cadres vérifiés
Version web	.../web/M6_Electro_Cours_Interactif.html	fichier autonome (figures en base64) : sommaire latéral, recherche plein texte, QCM auto-corrigé, 4 calculateurs, progression localStorage, mode sombre et mode impression
Figures	.../figures/	12 planches scientifiques PNG 300 dpi + SVG
Audit	.../audit/M6_Audit_Oral_Transcrit.docx / .md	audit technique + narration transcrite (~50 min de lecture)

Contrôle qualité

Audit	Portée	Score
Audit technique (scripts/audit_module6_electro.py)	format A4, marges 2,5 cm, Times New Roman 12 pt, interligne 1,5, hiérarchie de titres, en-têtes #003366, encadrés, illustrations, volume rédactionnel, ratio 16:9, densité, chevauchements	44/44
Audit d'évaluation (evaluation/audit_eval.py)	présence et taille des sources et des PDF, structure des épreuves (parties A/B/C), cohérence du barème	24/24

Les quatre modules du dépôt sont à 44/44 et 24/24.

Charte graphique

Bleu marine #003366 · accent violet électrophorèse #6a1b9a · corrigés-barèmes en rouge sobre
#a02c2c · Times New Roman 12 pt (DOCX) et Calibri (PPTX) · interligne 1,5 · marges 2,5 cm ·
encadrés Points clés #E8F4FD, Protocoles #FFF8E1, À retenir #E8F5E9, Attention #FBE9E9.

Régénérer le module

pip install --break-system-packages python-docx python-pptx matplotlib numpy pillow reportlab markdown

cd modules/module06_electrophorese/scripts
python3 build_all.py          # cours, TD, TP, diaporama, web, figures, audit (~17 s)

cd ../evaluation
python3 build_eval_pdf.py     # régénère les 4 PDF joints à cette release (~1 s)
python3 audit_eval.py         # vérification → 24/24

Modifier le seul fichier contenu_module6_electro.py puis relancer build_all.py met à jour les
quatre formats simultanément — aucune ressaisie n'est nécessaire.