Skip to content

Releases: moonbowterfly/dsh-bio-genie

dsh-bio-genie v0.1.4

Choose a tag to compare

@moonbowterfly moonbowterfly released this 15 Aug 20:09

修复:stdin 强制 UTF-8 后非法字节崩溃风险 → binary+容错解码。

dsh-bio-genie v0.1.3

Choose a tag to compare

@moonbowterfly moonbowterfly released this 15 Aug 20:07

修复 Python 桥接层编码:Windows 下强制 UTF-8(中文代码注释/输出不再损坏)。

dsh-bio-genie v0.1.2

Choose a tag to compare

@moonbowterfly moonbowterfly released this 15 Aug 19:48

修复 skill 加载报错:注册时补充 source/provider 字段(dsh skill 加载器严格校验)。

dsh-bio-genie v0.1.1

Choose a tag to compare

@moonbowterfly moonbowterfly released this 15 Aug 19:30

安装方式更新为 dsh 官方标准格式;package.json 补充 repository/homepage/bugs 字段。

dsh-bio-genie v0.1.0

Choose a tag to compare

@moonbowterfly moonbowterfly released this 15 Aug 19:03

dsh-bio-genie v0.1.0

🧬 生物信息学「许愿式分析」插件 for DeepSeek Harness — 说人话,出结果。

✨ 功能

  • bio_python 执行器:运行任意 Biopython 代码(比对/PDB/Phylo/motif/BLAST…),覆盖 100% 功能
  • 11 个语义化工具:GC 含量、翻译、限制酶、k-mer、文件 IO、Entrez 检索等高频操作
  • 15 个 Skill:主决策 skill + 14 领域配方(io/seq/align/blast/entrez/phylo/structure/motif/restriction…)
  • 零依赖自举:自动下载隔离 Python 环境(uv + Python 3.12 + venv + Biopython)到 $DSH_HOME/dsh-bio-genie/
  • 国内网络友好DSH_BIO_UV_BASE 镜像加速开关
  • 环境隔离-I isolated 模式,防宿主 PYTHONPATH 污染

📦 安装

dsh plugin add @dsh-bio/dsh-bio-genie   # 或 link: 本地路径

✅ 验证

  • 23/23 单元测试通过(含真实 NCBI 检索)
  • dsh 端到端验证:语义化工具 + 执行器双路径通过
  • workbuddy 两轮独立审查:P0 bug 修复 + IUPAC 回归修复 + CommOnly 酶库