Releases: moonbowterfly/dsh-bio-genie
Releases · moonbowterfly/dsh-bio-genie
Release list
dsh-bio-genie v0.1.4
修复:stdin 强制 UTF-8 后非法字节崩溃风险 → binary+容错解码。
dsh-bio-genie v0.1.3
修复 Python 桥接层编码:Windows 下强制 UTF-8(中文代码注释/输出不再损坏)。
dsh-bio-genie v0.1.2
修复 skill 加载报错:注册时补充 source/provider 字段(dsh skill 加载器严格校验)。
dsh-bio-genie v0.1.1
安装方式更新为 dsh 官方标准格式;package.json 补充 repository/homepage/bugs 字段。
dsh-bio-genie v0.1.0
dsh-bio-genie v0.1.0
🧬 生物信息学「许愿式分析」插件 for DeepSeek Harness — 说人话,出结果。
✨ 功能
- bio_python 执行器:运行任意 Biopython 代码(比对/PDB/Phylo/motif/BLAST…),覆盖 100% 功能
- 11 个语义化工具:GC 含量、翻译、限制酶、k-mer、文件 IO、Entrez 检索等高频操作
- 15 个 Skill:主决策 skill + 14 领域配方(io/seq/align/blast/entrez/phylo/structure/motif/restriction…)
- 零依赖自举:自动下载隔离 Python 环境(uv + Python 3.12 + venv + Biopython)到
$DSH_HOME/dsh-bio-genie/ - 国内网络友好:
DSH_BIO_UV_BASE镜像加速开关 - 环境隔离:
-Iisolated 模式,防宿主 PYTHONPATH 污染
📦 安装
dsh plugin add @dsh-bio/dsh-bio-genie # 或 link: 本地路径✅ 验证
- 23/23 单元测试通过(含真实 NCBI 检索)
- dsh 端到端验证:语义化工具 + 执行器双路径通过
- workbuddy 两轮独立审查:P0 bug 修复 + IUPAC 回归修复 + CommOnly 酶库