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Skills zh

hoptop edited this page Jul 25, 2026 · 1 revision

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技能

**技能(skill)**是一份打包好的工作流——包含指令、约定,通常还有辅助脚本——当你的请求匹配上时 agent 会自动加载。Wisp 内置了 42 个

你不需要按名字调用。你描述任务("折叠这条序列"、"找反对这个结论的文献"、"把这张图弄到能发表的水平"),匹配的技能自己加载。每个技能的 description 存在的意义就是让这个匹配足够可靠。

技能放在仓库的 skills/ 下,并被打包进安装包,所以发行版不需要源码树就能用。


结构预测与蛋白设计

GPU 驱动的折叠、对接和反向折叠模型。全部属于 biomodels 分类;除 MPNN 系列外都声明了 requirements: [gpu]

技能 作用 GPU
alphafold2 通过 ColabFold runner 做单体与多聚体结构预测。也能用自洽 pLDDT、ipTM、RMSD 验证设计序列。
openfold3 用 OpenFold3 做结构预测——AlQuraishi 实验室对 AlphaFold3 的开源权重 PyTorch 复现。
boltz 用 Boltz-2 预测蛋白/核酸/小分子复合物。
chai1 用 Chai-1 基础模型预测复合物。
esmfold2 Biohub ESMFold2 全原子共折叠——单序列与 MSA 两种模式;蛋白、DNA、RNA、配体。
diffdock 用 DiffDock-L 做小分子盲对接(扩散式)。
proteinmpnn 用 ProteinMPNN 把骨架反向折叠成序列。
ligandmpnn 带配体、核酸、金属上下文的反向折叠。
solublempnn 偏向胞质可溶性的反向折叠。

⚠️ alphafold2 会把你的序列发给第三方。 它使用 api.colabfold.com 上的公开 MMseqs2 服务器做 MSA。该站点没有公开的服务条款或隐私政策。每个技能都在自己的 frontmatter 里声明了所用的第三方权重和服务——在跑不能外传的序列之前,先去那里看一眼。

基因组与单细胞

技能 作用 GPU
evo2 用长上下文基因组基础模型 Evo 2 对 DNA 打分、嵌入、生成。
borzoi 从序列预测全基因组功能轨迹(RNA-seq、CAGE、DNase、ChIP);给变异的调控效应打分。
fair-esm2 用 Meta AI 的 ESM-2 做残基级和序列级蛋白嵌入。
scgpt 用 scGPT 做细胞嵌入与注释。
scvi-tools 概率式 scRNA-seq——scVI 批次校正隐空间、scANVI 半监督标签迁移、贝叶斯差异表达。

文献——bear-* 家族

九个技能共享同一条铁律:它们检索真实论文,绝不编造引用。 搜不到就如实说搜不到。检索走 scimaster-cli(由 local-env-setup 安装)。

技能 回答的问题
bear-support "有哪些真实文献支撑这个说法?"
bear-counter "审稿人会拿什么打这个?"——相反结论、边界条件、复制失败,按威胁程度排序
bear-review 正反一起看:支持侧最强证据 vs. 反对侧最危险的挑战
bear-scoop "我的 idea 是不是已经有人做了?"——投入前的撞车地图
bear-propose 立项前评估:撞车风险 + 安静区里的文献支撑 + 需要提前想清楚的挑战
bear-map 围绕一个概念的知识地图,每个节点都锚定真实论文。输出 Mermaid + 独立 HTML
bear-trace 一个问题是怎么演化来的——向前溯源,向后补最新进展
bear-onboard 快速入门新领域:概念版图(空间)+ 演化脉络(时间),一份报告
literature-review 完整的多源综述,从"这方向的奠基论文是哪篇"到最终综合

bear-supportbear-counter 配对最好用——对同一段话各跑一遍,就能同时看到两个方向的证据。

文档与配图

技能 作用
figure-composer 从一个论断、具体数据路径或已有图像,做出/改进可发表级的多面板配图
figure-style 正确性与可读性规则;画任何图之前加载,套用角色映射的字号与样式体系
journal-club-ppt 论文 PDF → 组会 PPT / 文献汇报
paper-narrative 评判并重塑稿件讲的故事——Figure 1 是不是钩子、配图顺序对不对
pdf-explore 回答那些必须读附件 PDF 正文才能答的问题
indication-dossier 适应症档案:患者人群、流行病学、疾病生物学、标准治疗、监管先例

环境与算力

技能 作用
local-env-setup 引导本地运行时——uv/Python、给 bear-* 用的 Node + scimaster-cli、多环境生信用的 pixi
compute-env-setup 在指定环境上搭建并验证可复现的 Python 或 R 环境
probe-compute-environment 检查已注册服务器,并持久化其硬件、调度器、运行时与权限画像
remote-compute-ssh 提交可恢复的 SSH 直连 Run,带实时进度、监控不过模型
remote-compute-modal 说明 Modal 边界,并把 Modal 工作负载迁移到受支持的 SSH Run
managed-model-endpoints 说明托管端点的边界,规划安全的接入方式
using-model-endpoint 调用已配置好的模型端点,并把这次推理记为一个 Run

扩展 Wisp

技能 作用
customize 创建专家或项目内技能,用的是 Wisp 真实暴露的工具
skill-creator 编写、校验、评测技能——包括调触发用的 description
self-awareness Wisp 真实的工具面与运行时边界;判断某件事该用哪个工具时查它

其他

技能 作用
browser-use 驱动你真实的、带登录态的 Chrome——打开、阅读、点击、填表、切标签
agent-infini 通过 InfiniSynapse CLI 做多轮数据分析,带数据库/RAG 上下文
product-self-knowledge 关于 Anthropic 产品事实的参考,避免模型瞎猜

自己写一个

直接说:"给我做一个能干 X 的技能" 就会触发 skill-creator。技能就是带 SKILL.md 的普通目录,所以项目内技能不过是你项目里的一个文件夹。customize 讲清了专家和技能怎么选——专家是存下来的 agent 人格,技能是可复用的工作流。

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