-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 54
Skills zh
hoptop edited this page Jul 25, 2026
·
1 revision
English · 简体中文
**技能(skill)**是一份打包好的工作流——包含指令、约定,通常还有辅助脚本——当你的请求匹配上时 agent 会自动加载。Wisp 内置了 42 个。
你不需要按名字调用。你描述任务("折叠这条序列"、"找反对这个结论的文献"、"把这张图弄到能发表的水平"),匹配的技能自己加载。每个技能的 description 存在的意义就是让这个匹配足够可靠。
技能放在仓库的 skills/ 下,并被打包进安装包,所以发行版不需要源码树就能用。
GPU 驱动的折叠、对接和反向折叠模型。全部属于 biomodels 分类;除 MPNN 系列外都声明了 requirements: [gpu]。
| 技能 | 作用 | GPU |
|---|---|---|
alphafold2 |
通过 ColabFold runner 做单体与多聚体结构预测。也能用自洽 pLDDT、ipTM、RMSD 验证设计序列。 | ✅ |
openfold3 |
用 OpenFold3 做结构预测——AlQuraishi 实验室对 AlphaFold3 的开源权重 PyTorch 复现。 | ✅ |
boltz |
用 Boltz-2 预测蛋白/核酸/小分子复合物。 | ✅ |
chai1 |
用 Chai-1 基础模型预测复合物。 | ✅ |
esmfold2 |
Biohub ESMFold2 全原子共折叠——单序列与 MSA 两种模式;蛋白、DNA、RNA、配体。 | ✅ |
diffdock |
用 DiffDock-L 做小分子盲对接(扩散式)。 | ✅ |
proteinmpnn |
用 ProteinMPNN 把骨架反向折叠成序列。 | |
ligandmpnn |
带配体、核酸、金属上下文的反向折叠。 | |
solublempnn |
偏向胞质可溶性的反向折叠。 |
⚠️ alphafold2会把你的序列发给第三方。 它使用api.colabfold.com上的公开 MMseqs2 服务器做 MSA。该站点没有公开的服务条款或隐私政策。每个技能都在自己的 frontmatter 里声明了所用的第三方权重和服务——在跑不能外传的序列之前,先去那里看一眼。
| 技能 | 作用 | GPU |
|---|---|---|
evo2 |
用长上下文基因组基础模型 Evo 2 对 DNA 打分、嵌入、生成。 | ✅ |
borzoi |
从序列预测全基因组功能轨迹(RNA-seq、CAGE、DNase、ChIP);给变异的调控效应打分。 | ✅ |
fair-esm2 |
用 Meta AI 的 ESM-2 做残基级和序列级蛋白嵌入。 | ✅ |
scgpt |
用 scGPT 做细胞嵌入与注释。 | ✅ |
scvi-tools |
概率式 scRNA-seq——scVI 批次校正隐空间、scANVI 半监督标签迁移、贝叶斯差异表达。 | ✅ |
九个技能共享同一条铁律:它们检索真实论文,绝不编造引用。 搜不到就如实说搜不到。检索走 scimaster-cli(由 local-env-setup 安装)。
| 技能 | 回答的问题 |
|---|---|
bear-support |
"有哪些真实文献支撑这个说法?" |
bear-counter |
"审稿人会拿什么打这个?"——相反结论、边界条件、复制失败,按威胁程度排序 |
bear-review |
正反一起看:支持侧最强证据 vs. 反对侧最危险的挑战 |
bear-scoop |
"我的 idea 是不是已经有人做了?"——投入前的撞车地图 |
bear-propose |
立项前评估:撞车风险 + 安静区里的文献支撑 + 需要提前想清楚的挑战 |
bear-map |
围绕一个概念的知识地图,每个节点都锚定真实论文。输出 Mermaid + 独立 HTML |
bear-trace |
一个问题是怎么演化来的——向前溯源,向后补最新进展 |
bear-onboard |
快速入门新领域:概念版图(空间)+ 演化脉络(时间),一份报告 |
literature-review |
完整的多源综述,从"这方向的奠基论文是哪篇"到最终综合 |
bear-support 和 bear-counter 配对最好用——对同一段话各跑一遍,就能同时看到两个方向的证据。
| 技能 | 作用 |
|---|---|
figure-composer |
从一个论断、具体数据路径或已有图像,做出/改进可发表级的多面板配图 |
figure-style |
正确性与可读性规则;画任何图之前加载,套用角色映射的字号与样式体系 |
journal-club-ppt |
论文 PDF → 组会 PPT / 文献汇报 |
paper-narrative |
评判并重塑稿件讲的故事——Figure 1 是不是钩子、配图顺序对不对 |
pdf-explore |
回答那些必须读附件 PDF 正文才能答的问题 |
indication-dossier |
适应症档案:患者人群、流行病学、疾病生物学、标准治疗、监管先例 |
| 技能 | 作用 |
|---|---|
local-env-setup |
引导本地运行时——uv/Python、给 bear-* 用的 Node + scimaster-cli、多环境生信用的 pixi |
compute-env-setup |
在指定环境上搭建并验证可复现的 Python 或 R 环境 |
probe-compute-environment |
检查已注册服务器,并持久化其硬件、调度器、运行时与权限画像 |
remote-compute-ssh |
提交可恢复的 SSH 直连 Run,带实时进度、监控不过模型 |
remote-compute-modal |
说明 Modal 边界,并把 Modal 工作负载迁移到受支持的 SSH Run |
managed-model-endpoints |
说明托管端点的边界,规划安全的接入方式 |
using-model-endpoint |
调用已配置好的模型端点,并把这次推理记为一个 Run |
| 技能 | 作用 |
|---|---|
customize |
创建专家或项目内技能,用的是 Wisp 真实暴露的工具 |
skill-creator |
编写、校验、评测技能——包括调触发用的 description |
self-awareness |
Wisp 真实的工具面与运行时边界;判断某件事该用哪个工具时查它 |
| 技能 | 作用 |
|---|---|
browser-use |
驱动你真实的、带登录态的 Chrome——打开、阅读、点击、填表、切标签 |
agent-infini |
通过 InfiniSynapse CLI 做多轮数据分析,带数据库/RAG 上下文 |
product-self-knowledge |
关于 Anthropic 产品事实的参考,避免模型瞎猜 |
直接说:"给我做一个能干 X 的技能" 就会触发 skill-creator。技能就是带 SKILL.md 的普通目录,所以项目内技能不过是你项目里的一个文件夹。customize 讲清了专家和技能怎么选——专家是存下来的 agent 人格,技能是可复用的工作流。
Wisp Science
English
- Home
- Getting Started
- Built-in Tools
- Skills
- Bioinformatics Databases
- Execution Contexts
- Interface Guide
简体中文