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Raúl Rodríguez Cruces edited this page Oct 23, 2018 · 43 revisions

Welcome to the C-13_wiki_demo wiki!

intro

Repositorio para wiki y herramientas de los usuarios del MRIlab

Contenido

/home ¿Qué es y cómo se usa?

Si bien /home guarda las configuraciones individuales de cada usuario el respaldo de los datos, como las imágenes debe realizarse en un directorio diferente, con el fin de mejorar el uso del cluster. Información aquí.

MRILab Wiki

Aquí se puede encontrar la información básica para ser usuario de MRILAB.

Atención

Recuerda que el clúster es un sistema que depende de que los equipos que lo forman estén activos y en condiciones adecuadas.

Este wiki intenta facilitar el uso del clúster y las maquinas que lo forman. Sin embargo si se presenta algún problema que no esté contemplado en este wiki por favor repórtalo al administrador del sistema. Evita reiniciar, apagar o desmontar los equipos que se encuentre en el clúster. De igual forma, siempre es buena práctica hacer Cerrar Sesión al terminar el día. A veces no funciona bien el cambio de usuario y podrías perder datos! Acostúmbrate a grabar tu progreso con alta frecuencia para evitar tristes pérdidas.

Bienvenido al Laboratorio de Imágenes de Resonancia Magnética. En esta sección se describe lo que es home. Además hay que conocer a Bash, que es un programa informático cuya función es interpretar ordenes; Basicos se encuentra la sintaxis más frecuente que él utiliza. Información para el grupo BIOINFO.

En esta sección se encuentran descritos los pasos para manipular los archivos de imagen (dicoms o niifti u otros). Aquí se describe como registrar, normalizar, transformar, reorientar, extraer, sumar, acoplar imágenes y más. Además de algunos enlaces a páginas interesantes.

Aquí se explica cómo está organizado el cluster, como se utiliza y los errores más frecuentes que se presentan durante su uso.

Uso del programa X2Go para el acceso remoto al cluster. Tanto dentro como fuera de la red del INB.

Aprende a hacer análisis de resonancia funcional y algunas herramientas de fsl.

Asuntos relacionados a imágenes pesadas adifusión, su procesamiento y tractografía.

Información acerca del procesamiento de imágenes para la obtención del grosor cortical y otras bondades de //FreeSurfer//

Preguntas frecuentes Apuntes sobre algunas tareas que a los usuarios les han costado trabajo y no quiere que se les olviden, y para que potencialmente les sean útiles a otros usuarios.

Links externos con diversas herramientas.

Links externos con diversas herramientas.

Tutoriales para anexar despues

Grosor Cortical

freesurfer

Procesamiento DWI

DWI_preprocessing

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