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MoleditPy Wiki

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2D で分子を描き、3D 座標を作成・測定・編集し、計算ソフトへ出力するためのガイドです。初めて使う場合はクイックスタート、導入済みなら画像付き入門へ進んでください。

基本の導入・設定は次の 2 行です。仮想環境は必要に応じて使えます。

pip install moleditpy-installer
python -m moleditpy_installer

やりたいこと	ガイド
インストールする	クイックスタート
まず操作を試す	最初の分子を作る
原子を動かし、ねじれ角を保つ	3D 編集と拘束
立体配置を確認する	R/S・E/Z
保存形式を選ぶ	ファイル形式
起動や変換で困った	トラブルシューティング

標準機能だけで描画から 3D 変換へ。画像付き入門で順番に試せます。

はじめに

• クイックスタート
• 最初の分子を作る・画像付き
• Python と pip

インストールと起動

• Windows
• macOS
• Linux
• Docker
• Windows ショートカット
• macOS ランチャー
• Linux ランチャー

基本操作とリファレンス

• ユーザーマニュアル
• キーとマウス操作
• ファイル形式と出力
• R/S と E/Z
• コマンドライン

3D 構造の作成と編集

• 2D から 3D への変換
• 測定・編集・拘束
• 力場の選択
• ダミー・ゴースト原子

プラグインと困ったとき

• プラグインの導入と管理
• トラブルシューティング
• Raspberry Pi の起動問題

プラグインと関連資料

• Plugin Explorer
• Plugin wiki
• Website
• Source and issue tracker
• Published manual
• Introduction video
• PySCF Calculator video

作者: HiroYokoyama。ライセンス: GPL-3.0。プラグインは別途導入します。セーフモードでは読み込みません。